Birçok hastalık gelişim özelliklerine bağlı olarak kemikler üzerinde çeşitli
izler bırakabilmektedir. Bu izlerin incelenmesiyle prehistorik ve protohistorik
insanların hastalıkları ve sağlık sorunları hakkında bilgi sahibi
olabilmekteyiz. Ancak her hastalık iskelet sistemini etkilememektedir. Bu
nedenle eski dönem insanlarının sağlık sorunları hakkındaki bilgilerimiz eksik
kalmaktadır. Hastalıkların bazıları farklı patolojik özelliklere sahip olsalar
da kemikleri benzer şekilde etkileyebilmektedirler. İskelet kalıntıları
incelenirken sıklıkla karşılaşılan hastalıkları aşağıdaki gibi
sınıflandırabiliriz.
1. Artiritis
2. Kırıklar
3. Enfeksiyonlar
4. Konjenital Anomaliler
5. Dolaşım Sistemi Hastalıkları
6. Tümörler
7. Metabolik Hastalıklar
8. Endokrin Hastalıkları
9. Kan Hastalıkları
10. Diğer Hastalıklar
İskeleti etkileyen hastalıkların yanı sıra dişlerde de tanımlanabilen ve yaygın görülen hastalıklar vardır. Bu hastalıklar ise, diş çürüğü, apse, periodontal hastalıklar, maloklüzyon v.b. dir.